1999年に放映され、ダイナミックな３DCGアクションで話題を集めた「ゾイド」の第２期シリーズ。今作は格闘技をテーマにして内容を一新、“ゾイドバトル”の頂点を目指す少年の熱い闘いを描く。前作のはるか未来、惑星Ziでは巨大機械生命体ゾイドを操る戦闘競技ゾイドバトルが流行していた。少年ビットもその参加者だ。彼の夢は、いつかゾイドバトルの頂点に立つこと。強力なライバルたちと激しい闘いを繰り広げるビットだったが、やがて悪の組織の陰謀が明らかに…。
“想洗清嫌疑，方法有很多，语言辩解只是其中的一种，但也是最无力的一种。实力也是一种辩解的方法！”
紫川秀，这位在魔族大营内孤身击杀紫川家叛徒的将领，在远东地区神秘圣庙守护长老的支持下，成为了远东地区数十万联合部队的首领。一位新的远东之王——光明王，诞生了！
少年仲人无意中闯入了绫小路博士的实验室，阴差阳错地启动了博士研究的钢铁天使胡桃，而胡桃也只把仲人视为主人，对他唯命是从，军队为了收回胡桃，先后派了另两位钢铁天使莎奇和佳玲加，但都失败了。原来整件事背后还有一个组织在操控着，而且博士也被他们劫走了，为了找出答案，仲人和胡桃一行人起身前往博士的秘密实验室。
晴朗明媚的一天，艾米（金元寿子 配音）在基地中向雷德（石川界人 配音）以及其他人讲解运送物资的重要性，其间提到任务失败就会变成废墟船甚至幽灵船的可怕结果，吓坏了在场的许多人，而雷德对“幽灵”似乎全然没有概念。正所谓说曹操曹操到，一组大型的废墟船团出现在基地附近。丽姬朵（大原沙耶香 配音）、贝露丝（伊藤静 配音）、皮尼欧（小西克幸 配音）、雷德以及艾米登上船团调查。皮尼欧趁机举行试胆大会，要好好吓吓雷德和艾米两人。另一边，废墟船团似乎触动了丽姬朵的心弦，她娓娓向贝露丝讲述了一段青葱往事…… 本片为同名TV动画第14集未放送话。
