《谁是爸爸》讲述了四个医生因为一个基因突变的新生儿而引发了一系列的情感纠葛，最终有情人终成眷属的故事。全剧围绕“谁是爸爸”这个主题，引出了夫妻之间、恋人之间、母女之间等多条感情线，生活中的情感悬疑，情与义、爱与恨、名与利在剧中表现得淋漓尽致，环环相扣的情节更是牵动人心。本剧由台湾著名导演孙树培执导，张国强、周蜜和崔鹏等人主演，并有刘雪华、寇振海、李颖和温海波等老戏骨倾力加盟。
故事发生在改革开放初期，李善军（李光洁 饰）邂逅了名为张玉霞（朱丹 饰）的女孩，两人之间产生了一些小小的误会，令张玉霞误将李善军认成了流氓，彼此之间心生龃龉。此时的两人并不知道的是，双方的父母正在积极的暗中撮合他们的婚事，最终，李善军和张玉霞化解了误会和矛盾，顺利的走到了一起，携手步入了婚姻的殿堂。 然而，婚姻生活并没有他们想象中的那么简单，它不再是两个人的私事，而是两个家庭和两种理念的碰撞。在锅碗瓢盆柴米油盐之中，李善军和张玉霞不可避免的频频争吵，他们的感情也在一次又一次矛盾中经受了暴风雨般的考验。
孤儿王小米虽然貌不出众，却是个乐观向上、充满正能量的可爱女孩。她一直暗恋着摄影奇才、帅气师哥杨家磊，而杨家磊爱的却是美籍交换生陈安妮。大学毕业，杨家磊为了留住陈安妮，精心策划了一场婚礼，王小米得知杨家磊要结婚的消息伤心欲绝。婚礼当天，陈安妮因恐婚落跑，情急之下身穿礼服的王小米阴差阳错被当成了新娘，由此便和杨家磊有了无法割舍的情缘。王小米善良、孝顺、重感情、识大体，不仅打动了杨家磊的父母，也渐渐融化了杨家磊内心的坚冰，两人终于假戏真做、结为夫妻。没想到的是，落跑新娘陈安妮突然出现。一边是当年深爱的恋人，一边是相濡以沫的妻子，杨家磊陷入矛盾中，王小米却用她的宽容和智慧，引导着杨家磊心甘情愿地回归家庭。
前缉毒警严谨在卧底贩毒集团调查陈年疑案时，与“似水流年”咖啡店老板季晓鸥相爱。一桩离奇的杀人案却将两人的爱情拖入深渊。真相迷雾重重，而严谨仿佛坠入无尽的黑暗，他和季晓鸥的爱情又将何去何从……
人过中年的女扳道工刘小站（江珊 饰）原本拥有幸福美满的家庭，但在丈夫冯国强（韩青 饰）的事业蒸蒸日上之际，她在家中遭遇“被下岗”的命运。冯与公司下属孙媛媛有染（石林 饰），转而以感情不和为名提出离婚。虽然得到不菲的抚恤金，可刘小站几乎还是净身出户离开了善良的公婆以及可爱的儿子。此后不久，国强迎娶媛媛，迫使儿子冯鑫在婚礼当天引出一场闹剧。小站也借此机缘结识了胆小嘴碎的出租车司机周勇（周小斌 饰）。周生活拮据，上有老母下有女儿，可是性格十分乐观。他和小站从最初斗嘴相厌，再到惺惺相惜，慢慢走到了一起。 而看似春风得意的冯国强，却要面临着无数的磨难与考验……
故事发生在抗日战争时期。猎户女儿李杏花（贾青 饰）目睹父亲惨死在日寇屠刀之下，而鬼子又欲行对自己不轨，关健时刻与其萍水相逢的张响（徐僧 饰）一改懦弱的性格，扑上前去砸死了正欲施暴的鬼子。两人双双投奔了抗日队伍。由于自幼跟父亲打猎，杏花有一手好枪法，他们跟王晓宝（焦博 饰）一起成了武工队的狙击手。为报杀母之仇，张响只身赴敌据点射杀日军曹桥本，这让前来执行任务的杏花误为张响己投降敌人，得不到信任的张响干脆加入了国民党军队。杏花决定嫁给王晓宝，婚礼之前她抛下新郎前去营救误入歧途的张响，幡然醒悟的张响重返武工队，这让未做成新郎的王晓宝妒火中烧，他站在了革命与背叛的十字路口上......
屡考不中的秀才杜云腾（陈浩民饰）阴差阳错的被误认成为欢喜县县令，与知晓杜云腾底细的捕快麦亚堂（林子聪饰）上演了一场夺权大战，并与欲卧底在衙门的女山贼曹天娇（林源饰），冒牌神医后人华盈盈，以及自卑的武功高手小强等人组成欢喜县衙。在两种价值观的碰撞之下，杜云腾与麦亚堂斗得难分难舍，从官场斗到情场，两人也在不知不觉间被对方所改变。他们联手破获案件、整顿欢喜县、惩恶扬善铲平恶霸、修建学堂造福百姓，在这过程中他们发现并最终成功地挫败了一场巨大的阴谋。
