美妙旋律第三季故事是发生在第一季的七年以后、第二季的四年以后,美爱等人已经从pretty top毕业并且学有所成。本作将有别于前作,以平行世界的东京、原宿作为舞台,原本只以"流行"及"舞蹈"为比赛中心的内容,更增添了一项新的"音乐"要素,描述一群能感知音乐的颜色、热度和味道的主角们,站上星光舞台达成梦想的故事。 主角彩濑奈露是个只要听音乐就能感受到声音的颜色,想像力丰富的中学二年级女孩,擅长装饰各式小物擅长装饰各式小物,梦想是希望能够开一间如「Dear Crown」那样引领时尚潮流的店。一天,她得知了即将开设的新店铺,将募集会跳三棱镜舞蹈的女中学生作店长。奈露也参加了甄选,并在众多参加者中脱颖而出,一路来到了最终面试。
外表纯良的少年美里优(泷本富美子 配音)自幼便失去了双亲,这么多年来,坚强的优一直都乐观的独自生活着。在一次公车劫匪事件中,优与名叫安藤麻幌(川澄绫子 配音)的少女相遇了,而巧合的是,后者正是准备到优家里应聘的女佣。于是,优和麻幌的同居生活就这样快乐的开始了。 有了麻幌的陪伴,优不再感到寂寞,而两人之间,渐渐的萌生出了超越主仆的感情。虽然身为老师的式条(高田由美 配音)和流河涛(子安武人 配音)经常给优制造着各种各样的麻烦,但打打闹闹的日子依然充满了欢笑。而就在这样的欢乐时刻,优才知道,麻幌曾是作为战士而被制造出来的机器人,而大限将至的她似乎和父母的死亡有着某些关联。
双亲因飞机失事而去世的龙一&虎太郎兄弟。收养了这两人的是,同样因事故而失去儿子儿媳的森之宫学园理事长。但条件是,龙一必须在学园内设置的保育室负责照顾小孩!为了做母亲的老师而在学园内设置的保育室。为了补足那里的人手不足而创设的“育儿部”,龙一成为了部员第一号……!?
由于联合军的阴谋,先帝戈萨十五世陛下驾崩,年少继位的阿萨琳十六世在大臣的极力推动下,发动了对联合宇宙军的全面战争。与此同时,联合宇宙军也在全力备战,招募士兵。在诱人的美女征兵广告前,杰斯迪·植木·泰勒动心了,于是他来到征兵处,面对入伍动机询问,他给出了以下经典回答:军队这种地方,吃饭不要钱,制服和生活日常用品全部都……不要钱!又不用担心房租,要取得各种执照也轻易,再加上搭乘宇宙战舰的话,到达敌方以前整天可以在冷气密封仓里睡觉,同时可以坐着做工作,没有比这更轻松的行业啦!不是吗?同时呀阁下!退役后又有退休年金可以过悠闲的生活,这实在令人向往呀!如此回答,基本上没人会让这种人加入军队的,然后,泰勒的演讲开始了!