美妙旋律第三季故事是发生在第一季的七年以后、第二季的四年以后，美爱等人已经从pretty top毕业并且学有所成。本作将有别于前作，以平行世界的东京、原宿作为舞台，原本只以"流行"及"舞蹈"为比赛中心的内容，更增添了一项新的"音乐"要素，描述一群能感知音乐的颜色、热度和味道的主角们，站上星光舞台达成梦想的故事。 主角彩濑奈露是个只要听音乐就能感受到声音的颜色，想像力丰富的中学二年级女孩，擅长装饰各式小物擅长装饰各式小物，梦想是希望能够开一间如「Dear Crown」那样引领时尚潮流的店。一天，她得知了即将开设的新店铺，将募集会跳三棱镜舞蹈的女中学生作店长。奈露也参加了甄选，并在众多参加者中脱颖而出，一路来到了最终面试。
彼得总是傻傻的可爱说着他的家庭: 他的妻子是一个沉溺于宝贝儿子的调皮的乐趣之中, 每天她都在设想怎么去控制她那一岁的儿子, 一岁等等布赖恩天生就是一个捣蛋鬼, 他会想出很多办法做出让他父母生气惊讶的事情, 还有一只会要热狗的狗狗组成了这样一个荒谬的家庭喜剧!
魔法世界，托里斯特因魔法学院，年轻人在这里学习魔法课程。 刚刚升入2年级的少女露易兹•德拉•瓦里埃尔因为一直以来施法成功率为0，被大家戏称为“零之露易兹”，她每次施法都无法成功，反而引起爆炸，把学院正常的学习生活搞的一团糟。 这一天，是魔法师一生一次的使魔召唤仪式，召唤的使魔将会与魔法师永远在一起。其他学生都顺利完成了使魔的召唤，而露易兹咒语一出，毫无意外的发生了爆炸。不过，露易兹还是召唤出了一个使魔——一位人类！东京的少年才人竟然来到了魔法世界，并被当作一位使魔！ 不知所措的才人与不把才人当人看的露易兹签订了契约，在这个魔法学院，东京的普通少年才人，他的命运会怎么样呢。
四年级生小翼从小和父亲相依为命，她生性害羞，一直和同学们格格不入。直到有一天晚上，她看到一艘宇宙飞船从天而降，受伤的外星人及惊吓过度的怪兽出现在她眼前。而更神奇的力量也瞬间发生。小翼从此具有超能力转变成破坏力十足的Fifure17,而当她回到小翼的现实身份时，一个和她长得一模一样的小光从此在她身边出现，她们两人都有能力转变成Figure17，于是，她们对抗外星生物的生涯从此开始了……
新一届全大陆高级魂师斗魂大赛即将开始，史莱克七怪在玄老的建议下代表唐门出战。霍雨浩修炼中途偶然在天梦的帮助下打开了牛天给的锦囊，知晓了王冬有致命暗伤这一秘密，并决意冒险为王冬摘取相思断肠草，出发时被王秋儿看到霍雨浩无奈让她同行。落日森林危机四伏，霍雨浩为拿到相思断肠草险些丧命，更加确定了自己对王冬的心意。回到史莱克后，霍雨浩经历多次救治也没能全部恢复，只能以半残的身体上阵。
