《谁是爸爸》讲述了四个医生因为一个基因突变的新生儿而引发了一系列的情感纠葛，最终有情人终成眷属的故事。全剧围绕“谁是爸爸”这个主题，引出了夫妻之间、恋人之间、母女之间等多条感情线，生活中的情感悬疑，情与义、爱与恨、名与利在剧中表现得淋漓尽致，环环相扣的情节更是牵动人心。本剧由台湾著名导演孙树培执导，张国强、周蜜和崔鹏等人主演，并有刘雪华、寇振海、李颖和温海波等老戏骨倾力加盟。
陈博之和苏庭雨是一对生活了三十多年的老夫妻，岁月的流逝似乎渐渐磨平了彼此之间的感情。当苏庭雨决定在退休之际结束这段婚姻时，陈博之却迎来了一个意外的访客——他的前女友心路。心路的到来不仅让陈博之尴尬难当，也让一直默默暗恋苏庭雨的林迁感到内疚。另一对夫妻，孔东南和范思萍，是体工大队的教练。正当他们为了金牌梦想全力拼搏时，范思萍却患上了肌无力症。为了不影响丈夫的训练，范思萍选择默默承受，而体贴的孔东南却了解了她的全部病情。为了安抚岳父和母亲，孔东南做出了一个令人惊叹的举动。 最后一对夫妻，马小波和庄丽，是一对刚刚步入婚姻殿堂的年轻夫妻。然而，爱情的热度在婚姻的现实面前逐渐冷却。庄丽追求浪漫，试图在婚姻中重燃恋爱时的激情，却对马小波提出了一系列近乎苛刻的要求，令他身心俱疲。正当马小波准备结束一切时，他却被身边邻居的善举所感动。这三对夫妻的故事展现了婚姻中的挣扎与成长，以及爱与理解的力量。
老马先生为了继承哥哥的遗产，带着儿子小马来到伦敦经营一家小古玩铺子。在中国传教的伊牧师的介绍下，他们寄居在寡妇温都太太和她的女儿玛力的家中。最初，温都太太不情愿接纳两位中国客人，但在伊牧师的劝说下和高额的房租之下，她勉强同意了。然而，随着时间的推移，老马和小马渐渐与温都太太和玛力产生了感情。老马已经失去妻子多年，漂泊异国他乡，感到孤独和寂寞，于是他开始喜欢上温都太太。温都太太起初对老马保持警惕，但渐渐地发现了他的温暖和体贴，以及多年来的孤独和苦闷，于是决定嫁给他。 然而，在准备购买结婚戒指的时候，一个珠宝店伙计的态度让温都太太意识到，她与老马之间存在着不可逾越的种族和文化鸿沟。她意识到自己无法跨越这个鸿沟，最终决定终止这段关系。对于小马来说，他深爱着玛力，但玛力却毫无回应，整天郁郁寡欢。尽管如此，玛力依然没有做出任何表示。
秉持着“损友”原则厮混多年的青梅竹马卢嘉嘉（李婷婷饰）和年孟宇（刘芮麟饰）在高中毕业后一起去上海读医科大学。年孟宇凭借自己的经济头脑和家庭关系开始在校创业，财迷卢嘉嘉则为给异地初恋男友买手机变身年孟宇“御用会计”顺便兼职“拾荒”。之后卢嘉嘉认清感情决定分手，年孟宇却被学校的古典美女孙晓慧（肖雨饰）吸引。孙晓慧作为情场高手玩弄年孟宇于股掌，在卢嘉嘉的帮助下才认清真相。此时，卢嘉嘉的代课学长姜枫喜欢上卢嘉嘉，年孟宇也渐渐意识到自己对卢嘉嘉的感情。非典的意外到来让三人开启同居生活，姜枫向卢嘉嘉表白却被拒绝。年孟宇终于意识到和卢嘉嘉多年损友背后的爱情真相
1948年春，保密局南京站二处侦防科科长李梅在一次行动中脑部受重创造成部分失忆，忘记了自己共产党员的身份。中共情报员佯装叛变设计让李梅的记忆复苏。和党组织恢复联系后的李梅配合组织完成任务，同时找准时机吸纳中央陆军大学战术教官高峰。保密局南京站站长胡一夫一直暗中监控李梅，李梅几次险象环生。期间她与高峰出生入死，擦出了爱情火花，结为连理。最终李梅协助高峰率部宣布起义，解放军百万雄师渡江，南京解放 。
