Following on from the sacrifice of the Castle of Lions, the Paladins and their allies need to figure out a way to recharge the Lions after their battle with Lotor, and a way back to home.
因双亲要在海外出差，所以一人留在日本的主人公以一年为期限住在了舅父的家里。之后转校到八十神高中的他得知一个深夜电视的传言在雨夜的十二时，只要看着关闭着的电视屏上自己的脸，就会浮现出另一个人的映像。主人公与同伴为了确认这一传言是否属实，不料被拉进了异空间，在那里被称为暗影的怪物袭击，与怪物接触时主角一行人的Persona能力觉醒。为了掘开深夜电视与连续杀人事件之间的关系，以及避免其他人被卷入该事件，他们组成了特别搜查队展开了战斗。
很久以前，那还是人类憧憬宇宙，满溢着开拓精神的时代。世界各国在太阳系各行星建设了新的都市，众多的人们在那里安定地度日。 在火星上建造的日本新都道府县之一，“第4东京都”。在这个都市的经济特区“雾科市”有着以航空宇宙事业闻名的超一流企业“雾科公司”。这个公司在各种领域扩展市场，也运营着名为“雾科科学技术学园”的私立学校。仅仅如此便已经很特殊了，但学园内还有着更加大放异彩的班级。白天在学园以学生身份努力学习，放学后以职员身份到公司上班，参与名为发展型试作火箭开发的重要项目。那就是“雾科公司先行技术开发部教育开发室”——通称“A-TEC”。 担任这个部门室长的年轻天才工程师濑良海斗，同时在学校还是A-TEC学生们的担任教师，被亲切（？）地称作热血火箭老师。 故事从转学生转入A-TEC开始。A-TEC迎来了新伙伴，但在前往火星的途中发生了转学生被绑架的事件。能渡过难关的只有自己这些人，如此判断的海斗与A-TEC的成员们一同，展开了前所未闻的救援作战——
居于轩辕宫的青云帝无意中惹恼水灵，人间洪水泛滥，青云帝选出人间十二种动物为生肖，救百姓于水火之中。经过重重遴选，鼠、牛、虎、兔、龙、蛇、马、羊、猴、鸡、狗、猪十二种动物荣幸当选为十二生肖，飞升天庭，谁知动物们难守天庭清规，闯下大祸，被玉帝贬下凡间。子鼠以十二生肖之首的身份踏上漫漫长路，在将其他生肖聚集身边的同时，也取得了人类的信任，最后，十二生肖齐心协力，以人类守卫者的身份与洪水猛兽决一死战，青云帝、民间百姓，各路动物纷纷前来相助，最终取得胜利，完成试炼，十二生肖众心合一，回到天庭顺利归位。
主人公水野贵弘过去在日本的马上长矛比武中所向披靡，于是为了测试自己的实力而到了国外留学进而参加更多大赛。在一次的大会中意外的受伤而导致败北，而后也从马上长矛比武引退，转修骑士辅助人员。 又到了将近马上长矛大赛的时期，为了培养出优秀的骑士，水野贵弘以辅助员的身份在学校中遇到了形形色色的高贵的大小姐们。 曾经受挫的骑士化作今日的骑士辅佐员，和少女骑士一起去拉开这持久激烈的战斗。
年幼的时候母亲因事故身亡的主角伊吹庆太，在某日夜晚遇到了名叫黑的流浪少女，她正是超越人类的存在——元神灵，神秘、残酷而壮烈的战斗从此展开……
原罪游戏降临现实世界，改变了所有人的正常生活。父母离奇失踪的楚夕冥冥中成为了天选之人，在游戏中获得了最高的消费权限。原罪游戏里危机四伏，离奇的事件，诡异的未知生物，以及随机的副本任务......幸好楚夕是原罪游戏中最富有的玩家，当别人还在千辛万苦求生的时候，楚夕已经靠着万亿功德值把游戏氪爆了！随着不断探知原罪游戏的的内容，楚夕也距离父母失踪的真相越来越近...
