《谁是爸爸》讲述了四个医生因为一个基因突变的新生儿而引发了一系列的情感纠葛，最终有情人终成眷属的故事。全剧围绕“谁是爸爸”这个主题，引出了夫妻之间、恋人之间、母女之间等多条感情线，生活中的情感悬疑，情与义、爱与恨、名与利在剧中表现得淋漓尽致，环环相扣的情节更是牵动人心。本剧由台湾著名导演孙树培执导，张国强、周蜜和崔鹏等人主演，并有刘雪华、寇振海、李颖和温海波等老戏骨倾力加盟。
1911年，武昌首义，全国光复，在日本学习化工的范旭东毅然回国，欲投身报国大业。官场黑暗让范旭东失望至极，遂立誓“实业救国”。突破技术和政治的重重难关，创办中国第一家盐碱化工厂“永久黄”。1937年，日军全面侵华，范旭东立刻将生产转为军工，制造出弹药，全力支援前线，在亡国灭种的危难时刻发挥了巨大的威力！1945年，抗战胜利后，范旭东积劳成疾，因病去世，毛泽东亲笔题写挽联：“工业先导功在中华”。
兽医郝运（陈赫 饰）因为一场猫咪配种事故，意外发现这个世界上有转化者存在。动物管理局带走郝运，但用各种办法都无法洗掉他的记忆，只好迫使他加入动物管理局。从此郝运和战斗力超强的吴爱爱（王子文 饰）组成搭档，开始处理一桩桩动物案件......开启了一个巨大而神秘的都市精灵世界的故事。
故事发生在二十世纪七十年代，凤凰小镇坐落在凤凰山下，是一个洋溢着宁静与安详气息的世外桃源。单纯善良的何三妹（练束梅 饰）爱上了在思想宣传队工作的李大庆（李健 饰），两人情投意合很快就走到了一起。然而这段感情却被一直暗恋着何三妹的杨豆筋（刘亭作 饰）抹黑成为了“奸情”，何三妹受到了组织的严厉惩罚，被发配到偏远的河东小学任教。 之后，杨豆筋又使诈，使得何三妹同李大庆之间产生了误会，杨豆筋此时趁虚而入，欺骗蒙蔽了天真的何三妹，让她成为了自己的新娘。在新婚之夜，何三妹终于识破了杨豆筋的真面目，可是一切都为时已晚，等待着何三妹的，是充满了屈辱和痛苦的婚姻生活。
徐默涵（舒砚 饰）出生于穷乡僻壤，却靠着个人的奋斗考上了著名大学的热门专业，成为了家乡人口相传的美谈。一转眼四年过去，徐默涵即将步入社会，做出足以影响她一生的决定。对于自己的前途，徐默涵的内心里自有一番打算，很早之前，她就决定为西部教育贡献出自己的力量，她向曾经的中学校长许下了承诺，成为一名乡村女教师。 然而，就当徐默涵做好了万全的准备即将动身之时，母亲的突然病倒令她背负上了巨大的经济压力。与此同时，让徐默涵没有想到的是，对于自己的信守承诺，老校长竟然并不十分赞同，他希望徐默涵能够飞上枝头变凤凰，而不是重新回到这个山沟沟里。
家境贫寒的女大学生魏盈盈偶遇一个一直跟着她的小男孩，叫信正正。而他因为患上PTSD，虽然8岁外表，却已经17岁了。几年后，长大的信正正始终忘不掉“姐姐”魏盈盈，他找到上班的魏盈盈，开始了对小姐姐的猛烈追求。但面对双方家庭贫富差距，信家婚约等种种问题，他们能有情人终成眷属吗？
清末，马贼绑架了清朝副都统的女儿陆璎，年轻的土匪陈九将其救出，两人成亲。在好友孙殿臣和沈中和的帮助下，陈九在哈尔滨开办了“宏发祥货栈”，并逐渐成为哈尔滨的皮货老大，因此招致日本商人庄本的嫉妒。庄本欲搞垮陈九，费尽心机。战争爆发，日本占领东北，庄本使用各种手段，使得“宏发祥”的生意日益艰难。这时，陈九得到一批羊皮，但庄本奉日本关东军之命，要用这批羊皮制作军服，为了不让羊皮落入庄本手中，陈九毅然决定将羊皮全部送给抗日的马贼。最终，庄本的计划落空，被关东军收押带回日本审讯；陈九的儿子即将诞生，陈九高兴不已，重获希望......
1948年春，保密局南京站二处侦防科科长李梅在一次行动中脑部受重创造成部分失忆，忘记了自己共产党员的身份。中共情报员佯装叛变设计让李梅的记忆复苏。和党组织恢复联系后的李梅配合组织完成任务，同时找准时机吸纳中央陆军大学战术教官高峰。保密局南京站站长胡一夫一直暗中监控李梅，李梅几次险象环生。期间她与高峰出生入死，擦出了爱情火花，结为连理。最终李梅协助高峰率部宣布起义，解放军百万雄师渡江，南京解放 。
