这是一个普通的少年结识上古器灵，在器灵协助下努力修炼，结识形形色色的人，经历各类或轻松或波折的冒险。生活开始走上正轨的故事。最终，他将成为超越大帝，守护整片大陆
外表纯良的少年美里优（泷本富美子 配音）自幼便失去了双亲，这么多年来，坚强的优一直都乐观的独自生活着。在一次公车劫匪事件中，优与名叫安藤麻幌（川澄绫子 配音）的少女相遇了，而巧合的是，后者正是准备到优家里应聘的女佣。于是，优和麻幌的同居生活就这样快乐的开始了。 有了麻幌的陪伴，优不再感到寂寞，而两人之间，渐渐的萌生出了超越主仆的感情。虽然身为老师的式条（高田由美 配音）和流河涛（子安武人 配音）经常给优制造着各种各样的麻烦，但打打闹闹的日子依然充满了欢笑。而就在这样的欢乐时刻，优才知道，麻幌曾是作为战士而被制造出来的机器人，而大限将至的她似乎和父母的死亡有着某些关联。
故事发生在战国时代，普通人家出身的男孩猪名寺乱太郎祖辈曾是忍者，在父亲的劝说下，他离开家乡摄津，进入当时一流的忍者学园学习。在学校，他认识了与之同龄的新兵卫和雾丸。新兵卫是一个出身富商家庭的小胖子，为人迷迷糊糊，对吃尤为感兴趣；雾丸则是身世贫苦的孤儿，为人精明，贪财吝啬。这三个性格迥异却的小家伙成为好朋友，他们最大的共同点就是经常因为考试不及格受到处罚。当然，以校长大川平次涡正为首的老师们也都是性格古怪且鲜明的爆笑人物，乱太郎他们和周围的同学、老师一起上演了连番搞笑、有趣的精彩好戏…… 本片根据漫画家尼子騒兵衛原著《落第忍者乱太郎》改编，改编成动画时，因NHK电视台的禁忌而将“落第”二字去掉。
为揭开秦烈里魂的秘密，本季中时光将回朔到秦烈刚刚加入器具宗外宗之时。彼时秦烈经李牧指点，为了寻找凌语诗，秦烈排除障碍通过了器具宗试炼，加入外宗。在唐思琪的指点下开始进行日常修炼。 由于在入宗考试中惹恼了唐思琪，秦烈在宗门内的生活处处被大师姐刁难。天长日久，二人之间竟然产生了一些不可名状的情愫。而这些也都被意图篡取宗门之位的梁少扬看在了眼里。期初梁少扬只是为了宗主之位接近唐思琪，但经过一段日子的接触，梁少扬也对大师姐产生了特殊的感觉……
