《谁是爸爸》讲述了四个医生因为一个基因突变的新生儿而引发了一系列的情感纠葛，最终有情人终成眷属的故事。全剧围绕“谁是爸爸”这个主题，引出了夫妻之间、恋人之间、母女之间等多条感情线，生活中的情感悬疑，情与义、爱与恨、名与利在剧中表现得淋漓尽致，环环相扣的情节更是牵动人心。本剧由台湾著名导演孙树培执导，张国强、周蜜和崔鹏等人主演，并有刘雪华、寇振海、李颖和温海波等老戏骨倾力加盟。
陈博之和苏庭雨是一对生活了三十多年的老夫妻，岁月的流逝似乎渐渐磨平了彼此之间的感情。当苏庭雨决定在退休之际结束这段婚姻时，陈博之却迎来了一个意外的访客——他的前女友心路。心路的到来不仅让陈博之尴尬难当，也让一直默默暗恋苏庭雨的林迁感到内疚。另一对夫妻，孔东南和范思萍，是体工大队的教练。正当他们为了金牌梦想全力拼搏时，范思萍却患上了肌无力症。为了不影响丈夫的训练，范思萍选择默默承受，而体贴的孔东南却了解了她的全部病情。为了安抚岳父和母亲，孔东南做出了一个令人惊叹的举动。 最后一对夫妻，马小波和庄丽，是一对刚刚步入婚姻殿堂的年轻夫妻。然而，爱情的热度在婚姻的现实面前逐渐冷却。庄丽追求浪漫，试图在婚姻中重燃恋爱时的激情，却对马小波提出了一系列近乎苛刻的要求，令他身心俱疲。正当马小波准备结束一切时，他却被身边邻居的善举所感动。这三对夫妻的故事展现了婚姻中的挣扎与成长，以及爱与理解的力量。
兽医郝运（陈赫 饰）因为一场猫咪配种事故，意外发现这个世界上有转化者存在。动物管理局带走郝运，但用各种办法都无法洗掉他的记忆，只好迫使他加入动物管理局。从此郝运和战斗力超强的吴爱爱（王子文 饰）组成搭档，开始处理一桩桩动物案件......开启了一个巨大而神秘的都市精灵世界的故事。
老马先生为了继承哥哥的遗产，带着儿子小马来到伦敦经营一家小古玩铺子。在中国传教的伊牧师的介绍下，他们寄居在寡妇温都太太和她的女儿玛力的家中。最初，温都太太不情愿接纳两位中国客人，但在伊牧师的劝说下和高额的房租之下，她勉强同意了。然而，随着时间的推移，老马和小马渐渐与温都太太和玛力产生了感情。老马已经失去妻子多年，漂泊异国他乡，感到孤独和寂寞，于是他开始喜欢上温都太太。温都太太起初对老马保持警惕，但渐渐地发现了他的温暖和体贴，以及多年来的孤独和苦闷，于是决定嫁给他。 然而，在准备购买结婚戒指的时候，一个珠宝店伙计的态度让温都太太意识到，她与老马之间存在着不可逾越的种族和文化鸿沟。她意识到自己无法跨越这个鸿沟，最终决定终止这段关系。对于小马来说，他深爱着玛力，但玛力却毫无回应，整天郁郁寡欢。尽管如此，玛力依然没有做出任何表示。
上世纪八十年代初期，西安一家制药厂青年女工吴鸿影，面对企业改制，她选择了离别丈夫到深圳“下海”。这位西安下岗女工从一家小酒吧做起，历经风雨，成为叱咤深圳房地产业的女强人。吴鸿影的丈夫王镐京坚守药厂，自强不息，在改革中，被任命为药厂驻深圳销售处经理。他发现，妻子吴鸿影和深圳一家医药公司的董事长沈自中有了恋情。三人由此陷入了情感与道德、婚姻与事业的漩涡。 剧情没有就此了结，再掀波折：就在三人备受煎熬中，在药厂与吴鸿影是好姐妹的药厂女工高小引在深圳闯荡中，也爱上了沈自中，又因得不到沈自中的爱情，设计将沈自中和王镐京打入监狱。吴鸿影经过多方调查，最终救出了王镐京和沈自中。经历这样的不平凡的生活洗礼，他们都开始理性思考：“人的一生到底应该追求什么，究竟应该去要什么。”剧末，王镐京选择回西安当厂长，带领药厂职工进行“第二次创业”…… 剧中王镐京因为在工厂给吴鸿影煮饺子而引发短路导致工厂要加班赶工，厂里要开除王镐京，吴鸿影不顾自己身上的伤痛和众人劝阻要来工厂加班，王镐京即心疼又欣慰，更是加班加点的修理短路的机器，顾不得满身的大汗和嘈杂的机械声。而陈刚经过化妆师的一番打造，拿起工具像模像样的捣鼓着机器，还真有几分工人的架势。
白玉莲（孟庭丽 饰）盗走了国库中的十万两黄金，委托长风镖局运送赃款，镖局少局主郭旭（何家劲 饰）担心其中有诈，便带上了天凤公主（何晴 饰）同行。白玉莲混入了镖局的队伍之中，谋划了一个惊天阴谋。 天凤公主于无意之中撞破了白玉莲的真实面目，害怕事情败露的白玉莲派出了杀手，追杀天凤企图灭口，所幸郭旭及时出手相救才幸免于难。最终，郭旭的人马敌不过白玉莲，导致黄金被劫，愤怒的郭旭发誓要追回黄金，将白玉莲绳之于法。就在这个节骨眼上，天凤公主被贼人掳走，陈玉莲则想出了一个奸邪之计，企图将长风镖局的人马全部歼灭。
故事发生在抗日战争时期。猎户女儿李杏花（贾青 饰）目睹父亲惨死在日寇屠刀之下，而鬼子又欲行对自己不轨，关健时刻与其萍水相逢的张响（徐僧 饰）一改懦弱的性格，扑上前去砸死了正欲施暴的鬼子。两人双双投奔了抗日队伍。由于自幼跟父亲打猎，杏花有一手好枪法，他们跟王晓宝（焦博 饰）一起成了武工队的狙击手。为报杀母之仇，张响只身赴敌据点射杀日军曹桥本，这让前来执行任务的杏花误为张响己投降敌人，得不到信任的张响干脆加入了国民党军队。杏花决定嫁给王晓宝，婚礼之前她抛下新郎前去营救误入歧途的张响，幡然醒悟的张响重返武工队，这让未做成新郎的王晓宝妒火中烧，他站在了革命与背叛的十字路口上......
