Muv-Luv ATE全名为《Muv-Luv Alternative Total eclipse 》，全集动画片改编自《Muv-Luv Alternative》的外传小说。故事的时间设定在西元2001年，由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略，正面临灭亡的危机，因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”，各个国家均派遣了专门人员参与其中，该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。 （有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.）
在一个被称作『逆JAPAN』的空间，每隔44年就会打开一次“妖逆门”释放大量妖怪，一位神秘的少年多闻三志郎将在这里展开异想天开的奇异冒险。
恶梦没有结束，绝望诱使毁灭，灾厄招来祸端——与“破坏者”扎格纳特塔塔开中，贝尔和琉坠入深渊。到达之处是所有冒险者都畏惧的迷宫深处——深层。两人伤痕累累，孤立无援，灾厄的威胁就在眼前。迷宫决死之行中，被五年前的悔恨折磨的琉回忆起来往昔的伙伴。另一边，贝尔消失的队伍前出现了双头龙——阿非斯·贝那。破坏的化身能喷射出毁灭一切的炎流。在失去希望和光明的迷宫中，冒险者们迎来的是终结还是……这是少年和妖精在死境中求生，充满残酷的“眷族故事”。
居于轩辕宫的青云帝无意中惹恼水灵，人间洪水泛滥，青云帝选出人间十二种动物为生肖，救百姓于水火之中。经过重重遴选，鼠、牛、虎、兔、龙、蛇、马、羊、猴、鸡、狗、猪十二种动物荣幸当选为十二生肖，飞升天庭，谁知动物们难守天庭清规，闯下大祸，被玉帝贬下凡间。子鼠以十二生肖之首的身份踏上漫漫长路，在将其他生肖聚集身边的同时，也取得了人类的信任，最后，十二生肖齐心协力，以人类守卫者的身份与洪水猛兽决一死战，青云帝、民间百姓，各路动物纷纷前来相助，最终取得胜利，完成试炼，十二生肖众心合一，回到天庭顺利归位。
故事設定在《CODE GEASS 反叛的魯路修》的四年後 講述了兩名以高超的武藝廣為人知的傭兵，亞修和羅瑟的故事
四年级生小翼从小和父亲相依为命，她生性害羞，一直和同学们格格不入。直到有一天晚上，她看到一艘宇宙飞船从天而降，受伤的外星人及惊吓过度的怪兽出现在她眼前。而更神奇的力量也瞬间发生。小翼从此具有超能力转变成破坏力十足的Fifure17,而当她回到小翼的现实身份时，一个和她长得一模一样的小光从此在她身边出现，她们两人都有能力转变成Figure17，于是，她们对抗外星生物的生涯从此开始了……
解放封印，额头出现龙之纹章时，新的真王传说即将宣告开始！ 这时代出生的摩陀罗，在其出生时的声音同时将魔王米洛克全身的灵力夺取，并丢往黑暗世界去。15年后，灼热的沙漠，在这养育他长大的亲人汰汰罗，将其全身装上机械装置，而摩陀罗也长大成一少年。长年的流浪，最后两人来到和平的尼索之社，并和麒麟相遇，这段期间也得到休息；但好景不常，米洛克的魔爪却来到了这个平和之社。村人被虐杀，连汰汰罗也身负重伤而倒地。另一方面，此刻隶属于米洛克军队的亡国之王子夏凰翔和圣邪神，也倒戈相向并脱离须弥山之控制。在与米洛克军队战斗之中，摩陀罗、麒麟和夏凰翔、圣邪神之宿命邂逅会如何发展下去？心中各有所思的他们，同时前往米洛克帝王所在之须弥山踏上旅程！ OVA 魍魎戦記マダラ 上巻 胎蔵編 魍魎戦記マダラ 下巻 金剛編
故事发生在战国时代，普通人家出身的男孩猪名寺乱太郎祖辈曾是忍者，在父亲的劝说下，他离开家乡摄津，进入当时一流的忍者学园学习。在学校，他认识了与之同龄的新兵卫和雾丸。新兵卫是一个出身富商家庭的小胖子，为人迷迷糊糊，对吃尤为感兴趣；雾丸则是身世贫苦的孤儿，为人精明，贪财吝啬。这三个性格迥异却的小家伙成为好朋友，他们最大的共同点就是经常因为考试不及格受到处罚。当然，以校长大川平次涡正为首的老师们也都是性格古怪且鲜明的爆笑人物，乱太郎他们和周围的同学、老师一起上演了连番搞笑、有趣的精彩好戏…… 本片根据漫画家尼子騒兵衛原著《落第忍者乱太郎》改编，改编成动画时，因NHK电视台的禁忌而将“落第”二字去掉。
